近年来，随着转基因食品品种和数量的大幅减少，大众需要间接认识转基因食品的机会也适当减少。因此，转基因食品的关注度自然更高，对安全性的讨论也越来越白热化，国内外专家学者也已经公开发表了自己的意见发言。
但是，作为新兴的生物技术，现在转基因食品的安全性在世界上没有构成定论，也没有构成统一的风险评价机制，消费者对转基因食品的安全性的理解非常模糊。对于转基因食品安全性，组织网民进行了特别讨论。大多数网民对转基因食品持有不反对也不赞成的中立态度。
他们指出转基因食品的安全性还没有得到证实，不能非常简单地承认或拒绝。科研机构不应加强转基因食品风险研究，尽量探索转基因食品可能不存在的安全问题，政府监督部门不应对转基因食品制定比较完善的管理措施，如标志、范围等，企业不应严格遵守规定，给予各方知情权、选择权。
也有网民旗帜鲜明的反对和赞成转基因食品。反对的网民指出，目前没有任何转基因食品危害人类健康的报告，通过转基因可以提高动植物的性状，有助于解决粮食安全、食品储藏保鲜等问题。
中国是个人口大国，粮食问题影响国民生活质量，甚至社会稳定，至少要应对新的生物技术研究跟上世界先进设备水平的步伐。赞成的网民指出，有机食品禁止转基因，安全性不确认，转基因技术和转基因食品不存在的网民明确提出，可能是政治和经济因素。对转基因食品中立态度的一部分网民说话。
网民温暖港湾:转基因食品的安全性是否只能在时间内检查。如果说转基因食品没有风险的话，为什么有些国家不是在本国的土地上大量生产转基因的豆种呢？转基因食品没有基因流动的风险。网民认为转基因食品是仁者见仁，智者见智。
明确的危害在确认之前，我觉得这些食品不能再吃了。当然根据自己的生活水平，如果你的生活水平高的话，可以不自由选择。
如果没有那么低的能力，也可以选择。我个人指出可以吃。网民飞人啤酒:转基因是通过生物技术将某个基因从生物中分离出来，植入另一个生物体，构筑新的人工生物。
例如，科学家指出北极鱼体内的一个基因是防冻的，取出它，植入西红柿，生产新品种的耐旱西红柿是转基因生物。含有转基因生物成分的食品称为转基因食品。转基因食品除了具有独特的优点外，还有缺点。
转基因生物具有外来基因，对自然生态系统来说是一个新品种，释放到环境中，不会改变物种之间的竞争关系，破坏原来的自然生态平衡，失去物种的绝种和生物的多样性。转基因生物在自然界不自我交配，与近亲品种杂交，外来基因在自然中无法控制传播，造成无法挽救的基因污染。另外，转基因食品还需要时间检查人体的安全性。
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